スペシャルセミナー情報

月に一度、第一線で活躍されている研究者をお招きしてスペシャルセミナーを開催しています。
関心のある方は是非ご参加ください。セミナー終了後には簡単な懇親会も行っております。


■ 日時:4月26日 16:00-
■ 場所:京都大学北部キャンパス 農学部総合館 W506号教室



「局所適応の地理的パターンの解明を目指して:東アジアに広域分布する野生植物コンロンソウについてのゲノムワイド解析」
岩崎 貴也 博士 (京都大学生態学研究センター学振PD)
分布域の広い野生生物は、その範囲内の多様な自然環境に対して各地域で独立に適応していると思われる。しかし、どのような遺伝的変化によって その適応がもたらされたかという遺伝的基盤を明らかにした研究はまだ少ない。また、適応遺伝子が「どの地域でどの程度の適応を担っているか」 という局所適応の地理的パターンを推定した研究に至っては、シロイヌナズナやポプラといったモデル生物におけるいくつかの研究例以外、ほとん ど無いのが現状である。 本研究では、上記のことを明らかにするため、東アジアに広く分布するアブラナ科の植物コンロンソウに着目した。まず、分布域全体からの高密度 サンプリング(200地点396個体)と、RAD-Seq解析で得られたゲノムワイドSNP(8,308 SNPs)の情報によって、大陸系統-日本系統の間の大きな遺 伝的分化や、その中での各地域間での小さな分化を検出した。更に、各採集地点の環境情報(気温、降水量、標高など)を用いたゲノムワイド関連 解析によって、中立な遺伝的分化から大きく外れて、特定の環境要因に選択を受けて分布していると思われる非中立SNP(近傍に適応遺伝子が存在 する可能性が高い)を複数検出した。それらのSNPsの周辺には、病原菌耐性遺伝子や開花制御に関わる遺伝子FLCなど、何らかの局所適応に関わる 可能性が考えられる機能を持つようなものも多く含まれていた。これらの機能遺伝子が実際にどのようなメカニズムで局所適応に関わっているかを 明らかにすることはまだできていないが、これらにかかっていると思われる自然選択の様子は非中立SNPsの分布パターンから推定可能である。本発 表の最後には、これら非中立SNPsの分布情報を用いて分布適地モデリングを行い、この種における局所適応の地理的パターンを地図上で推定した結 果についても紹介する。



※ 京都大学北部構内、農学部総合館の位置は以下のリンク(京都大学HP)から地図をご参照ください。
京都大学吉田キャンパス構内配置図
北部構内マップ


過去のスペシャルセミナー情報はこちら


2008年 4月 工藤 洋 氏
2008年 5月 Shuang-Quan Huang 氏
2008年 6月 堂囿 いくみ 氏
2008年 7月 半谷 吾郎 氏
2008年10月 北山 兼弘 氏
2008年11月 Elizabeth Elle 氏
2008年11月 津田 吉晃 氏・吉田 貴徳 氏
2009年 1月  加藤 真 氏
2009年 2月 只木 良也 氏
2009年 4月 遠藤 力也 氏
2009年 6月 本間 淳 氏・持田 浩治 氏
2009年11月 玉木 一郎 氏
2009年12月 志賀 隆 氏
2010年 1月 辻野 亮 氏
2010年 3月 横井 智之 氏
2010年 4月 河村 耕史 氏
2010年 5月 Hajanirina Rakotomanana 氏
2010年 7月 花岡 創 氏
2010年10月 岸本 康誉 氏
2010年11月 伊藤 昌明 ・・
2010年12月 瀬戸口 浩彰 氏
2010年 1月 三井 祐樹 氏
2011年 5月 佐藤 拓哉 氏
2011年 6月 石田 厚 氏
2011年 7月 村山 美穂 氏
2011年10月 丑丸 敦史 氏
2012年 1月 東樹 宏和 氏
2012年 2月 篠原 渉 氏
2012年 5月 境 優 氏
2012年 5月 大住 克博 氏
2012年 6月 福島 慶太郎 氏
2012年 6月 福本 繁 氏
2012年 7月 下野 嘉子 氏
2012年10月 中田 兼介 氏
2012年11月 高原 光 氏
2012年12月 菊沢 喜八郎 氏
2013年 4月 永野 惇 氏
2013年 5月 高橋 鉄美 氏
2013年 7月 大園 享司 氏
2013年 7月 吉川 夏彦 氏
2013年10月 幸田 良介 氏
2013年11月 酒井 章子 氏
2013年12月 米谷 衣代 氏
2014年 1月 小野田 雄介 氏
2014年 2月 末次 健司 氏
2014年 4月 杉浦 ・^治 氏
2014年 5月 冨永 達 氏
2014年 6月 藤木 大介 氏
2014年 7月 神崎 護 氏
2014年10月 関 伸一 氏
2014年12月 関島 恒夫 氏
2014年12月 川北 篤 氏
2015年 4月 源 利文 氏
2015年 5月 Gildas Gateble 氏
2015年 6月 手塚 あゆみ 氏
2015年 7月 Qiu Yingxiong 氏
2015年10月 森光 由樹 氏
2015年11月 飯田 佳子 氏