Forest Biology Lab.

２００７年にRAD sequencingという方法が発表されました。この方法では、複数 個体のサンプルから一度に数千以上の一塩基多型（SNPs）を取得し、その遺伝子 型を決定することが出来ます。そのため、核の遺伝情報による集団遺伝学的解析 やquantitative trait loci (QTL) 解析などに応用でき、すでに数多くの研究が 行われています。本セミナーでは、このRAD sequencingの原理を紹介するととも に、サンプル処理や解析ソフトstacksの使い方についてもお話ししたいと思いま す。また、この方法を応用した例として、あるシクリッド（Cyprichormis leptosoma）の色彩二型が１遺伝子座２アリルのメンデル遺伝に従い、その遺伝 子が第２１連鎖群の160 kbp程度の領域にあることを示した研究についても、ご 紹介したいと思います（Takahashi et al. Early View, Mol Ecol）。